Патогенетический анализ природы осложнения невозможен без ясного представления о морфологическом субстрате, так же как точная морфологическая характеристика субстрата (в случаях со смертельным исходом) необходима для ретроспективного заключения о существе осложнения. Поэтому в систематику осложнений должен быть включен перечень основных морфологических признаков патологических процессов. Наконец, при постановке диагноза осложнения нужно обязательно охарактеризовать расстройства функции органа, обусловленные патологическим процессом.
Следует отобразить степень нарушения, достаточность функции (т. е. степень напряжения механизмов компенсации) либо ту или иную степень недостаточности. Такая графа в классификации необходима, ибо она дает представление о нарушениях в целостном организме, развивающихся вследствие патологического процесса в одном из органов.