Василий Чеботарев родился в 1918 году в селе Гавриловиа Рузаевского района Кокчетавской области. В рядах Советской Армии служил с 1938 года. Член КПСС.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 29 июня 1945 года ему посмертно присвоено звание Героя Советского Союза.
В августе 1941 года Василий Михайлович встал в ряды защитников Родины. В те трудные для Родины дни он вел большую воспитательную работу среди воинов 3-го танкового батальона 19-й гвардейской танковой бригады.
В июле 1942 года за боевые подвиги лейтенант В. М. Чеботарев был награжден орденом Красной Звезды.
В июне 1944 года во время выполнения боевой задачи по захвату переправы в районе села Бобр в Минской области гвардии лейтенант Чеботарев вместе с батальоном прорвался в тылы противника. Уничтожил 10 фашистских солдат и офицеров. Пропагандиста гитлеровской армии обер-лейтенанта Ряглинова взял в плен и решил доставить его в отдел контрразведки, но был окружен. Чеботарев вступил в единоборство с Ряглиновым и убил его. Фашисты захватили советского офицера, нанесли ему пять ножевых ран, а затем выкололи глаза.
Когда гитлеровцы были выбиты из села, боевые друзья Василия Чеботарева с воинскими почестями похоронили героя.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 29 июня 1945 года гвардии лейтенанту Василию Михайловичу Чеботареву посмертно присвоено звание Героя Советского Союза.
В селе Рузаевка одна из улиц носит имя Героя. Гавриловская средняя школа названа именем В. М. Чеботарева. Молодое поколение Кокчетавщины учится верности Отчизне у своего земляка, отдавшего жизнь в борьбе с фашизмом.